Desarrollan una base de datos y software para combatir la resistencia a antifúngicos

La resistencia a los antifúngicos se ha convertido en una amenaza creciente para la salud global, siendo recientemente reconocida por la Organización Mundial de la Salud (OMS) como una de sus prioridades sanitarias. A pesar de su impacto significativo, los hongos han recibido menos atención que las bacterias en los programas de vigilancia y desarrollo de medicamentos, lo que plantea un desafío considerable.

Aunque el avance en la secuenciación masiva de ADN ha permitido progresos notables en la investigación del microbioma y la resistencia a antibióticos, la falta de bases de datos integrales y referencias adecuadas complican el estudio de la resistencia a antifúngicos. Esto se debe a la complejidad del genoma eucariótico, que dificulta el análisis in silico a gran escala.

Creación de FungAMR: Una Base de Datos Innovadora

Para abordar esta problemática, un equipo internacional liderado por el Instituto de Biología Funcional y Genómica (IBFG, CSIC–USAL), junto con la Universidad de Salamanca y la Université Laval (Canadá), ha desarrollado FungAMR. Esta base de datos recoge más de 50.000 entradas y 35.000 mutaciones genéticas identificadas en 95 especies de hongos, relevantes tanto clínicamente como en el ámbito agrícola y ambiental.

FungAMR está asociada a 246 proteínas, las cuales confieren resistencia a un total de 208 antifúngicos. La información ha sido extraída manualmente de más de 500 estudios científicos, clasificada según el nivel de evidencia experimental, lo que permite evaluar la fiabilidad científica detrás de cada mutación. Este trabajo ha sido publicado recientemente en la revista Nature Microbiology.

Análisis Genómico con ChroQueTas

Además, el equipo ha creado el software ChroQueTas, una herramienta bioinformática innovadora que permite analizar genomas y proteomas fúngicos, detectando automáticamente mutaciones relacionadas con la resistencia a antifúngicos. Este software está disponible como código abierto, facilitando así el cribado genético rápido y preciso.

"En las pruebas realizadas con genomas previamente estudiados, ChroQueTas ha reportado mutaciones ya descritas y también ha identificado nuevas mutaciones no documentadas anteriormente", afirma Narciso M. Quijada, investigador del IBFG. Esto demuestra su potencial como herramienta clave para la vigilancia genética.

Desafíos en el Tratamiento y Disponibilidad del Software

A través del análisis realizado, se revela que muchas mutaciones confieren resistencia a múltiples antifúngicos simultáneamente, fenómeno conocido como resistencia cruzada. Este problema es exacerbado por el uso masivo de antifúngicos en agricultura, especialmente azoles, lo que representa una presión evolutiva significativa sobre los hongos patógenos.

FungAMR ya está accesible como interfaz web dentro del portal del Comprehensive Antibiotic Resistance Database (CARD) y se actualizará periódicamente con nuevos datos. Los usuarios pueden contactar al equipo a través del correo electrónico fungamr.db@gmail.com.

ChroQueTas, por su parte, se presenta como un proyecto dinámico abierto a mejoras continuas y colaboraciones futuras. Su disponibilidad como software libre promete facilitar aún más las investigaciones en este campo crucial para la salud pública.

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